The Thinking Game과 Alphafold3 설치기- 작성 중

유투브가 여유롭고? 좋은 시기를 맞아 영화를 하나 추천해줬습니다.
데미스 하사비스(Demis Hassabis)와 딥마인드의 AI모델들에 대한 다큐멘터리 영화 The Thinking Game을 보았습니다. 세계 최고의 인공지능연구소인 딥마인드와 인공지능 기술에 신중하며 안정적인 자세를 유지할 수 있는 하사비스의 마인드에 관해 생각거리를 주는 흥미로운 영화입니다. 개인적으로는 왜 강화학습으로 AGI를 구현하려고 하는지에 대해 알게되었습니다.  몇년 전 알파폴드 오픈소스화 소식을 알려주며 흥분에 찼던 대학원 형님이 생각났습니다. 디지털 생물학을 열어버린 알파폴드를 한번 돌려보겠습니다.
 
*영화 말미에 전세계의 알파폴드 활용사례 데이터가 나오는데 우리나라는 안보였습니다. ㅋ~

 
https://youtu.be/d95J8yzvjbQ?si=JdgHfrx1hnmO8p2j

 
 
 
 
먼저  깃허브에서 알파폴드3를 찾아봅니다.
https://github.com/google-deepmind/alphafold3.git
 
안내 중간에 딥마인드에서 학습시킨 알파폴드3 모델을 받고 싶다면 접근신청 설문을 작성해야합니다. 일단 보냅니다~

 
 

 
 
 
nvme용량을 1테라정도 비우고 레포를 복제합니다.
저는 우분투24.04, 메모리 128gb, 그래픽카드 rtx5090의 환경입니다.
 

 
스크린샷 중간 설치한 라이브러리는 웹사이트의 보안 인증서(SSL/TLS), GPG(GNU Privacy Guard) 디지털 서명을 검증합니다.
 
 
 
q@q-d:~/projs/alphafold3$ sudo install -m 0755 -d /etc/apt/keyrings
curl -fsSL https://download.docker.com/linux/ubuntu/gpg | sudo gpg --dearmor -o /etc/apt/keyrings/docker.gpg
sudo chmod a+r /etc/apt/keyrings/docker.gpg
 
 
 
 
 
 
 
 

 
 
 
 
 
 
 
 
q@q-d:~/projs/protein_databases$ sudo apt update
sudo apt install tmux -y
 
 

 
 
q@q-d:~/projs/protein_databases$ tmux new -s af3_download
[detached (from session af3_download)]
 
 
5초마다 데이터베이스 용량 업데이트를 확인해봅니다.
q@q-d:~$ watch -n 5 du -sh ~/projs/protein_databases/*

 
 

 
 

 

 

 

 

 

 
자~ 이제 알파폴드 튜토리얼입니다^^
 
https://www.ebi.ac.uk/training/online/courses/alphafold/

AlphaFold - A practical guide